「高雄市輪船股份有限公司」輪船公司原隸屬於公共車船管理處，於94年1月1日改制，期藉由法令鬆綁，以多角化、企業化、管理自主化進行「異業策略聯盟」，使公司經營策略更靈活、具有競爭性，並配合政府公共政策，盱衡觀光、運輸市場與經濟等發展趨勢及事業執行計畫能力，建立員工成本控制觀念，培養團隊精神，以促進整體經濟及提升事業經營績效。
輪船公司主要經營項目為港內交通渡輪、觀光遊港輪，權管碼頭共6處：鼓山輪渡站、旗津輪渡站、前鎮輪渡站、中洲輪渡站、新光碼頭、棧貳庫碼頭；渡輪航線共3條：鼓山-旗津航線、前鎮-中洲航線、棧貳庫-旗津航線，及港內觀光遊港航線。
輪船公司現有船舶23艘(交通渡輪8艘、觀光遊港輪3艘、太陽能愛之船12艘)，並受文化局委託管理文化遊艇3艘。
